عنوان
مطالعه رابطه ساختمان-فعاليت كمي دوبعدي و داكينگ مشتقات مهاركننده آنزيم تيروزين كيناز رسپتور فاكتور رشد اپيدرمي
محل تحصيل
رشت
چكيده
مقدمه: مشتقات مهاركننده آنزيم تيروزين كيناز رسپتور فاكتور رشد اپيدرمي نقش مهمي را در درمان سرطان ايفا مي كنند. با استفاده از مطالعات مربوط به رابطه ساختمان-فعاليت كمي، مي توان ميزان فعاليت كانديدهاي دارويي را در مراحل ابتدايي اكتشاف دارو پيش بيني كرد. همچنين با استفاده از مطالعات داكينگ مولكولي، مي توان ميزان قدرت و نحوه ي اتصال تركيبات به رسپتور را بررسي نمود.
مواد و روش ها: در اين پژوهش از 128 تركيب از 6 دسته ي ساختاري مختلف با تفاوت هاي جزئي در ساختار استفاده شد. انواع مدل¬هاي مربوط به رابطه ي ساختمان-فعاليت كمي دوبعدي با استفاده از روش هاي خطي مانند رگرسيون خطي چند متغيره و روش هاي غيرخطي نظير شبكه هاي عصبي مصنوعي و ماشين¬هاي بردار پشتيبان طراحي شدند. جهت انجام داكينگ مولكولي از 3 تركيب از هر دسته ساختاري كه داراي بيشترين pIC50 بودند، استفاده شد. از روش هاي اعتبارسنجي داخلي و خارجي جهت معتبرسازي مدل ها استفاده شد.
نتايج: انتخاب توصيف گرها نشان داد كه الكترونگاتيويته اتمي، قابليت ايجاد پيوند هيدروژني، ميزان ليپوفيليسيته و شكل و حجم مولكولي از عوامل مؤثر بر فعاليت تركيبات هستند. معيارهاي آماري مربوط به تفسير و اعتبارسنجي مدل ها در بازه مناسبي قرار گرفتند. ميزان ΔGbind كمپلكس هاي ليگاند-رسپتور، عددي منفي به-دست آمد و مشخص شد كه انواع برهم كنش هاي هيدروژني و هيدروفوب در اتصال تركيبات به رسپتور نقش دارند.
نتيجه گيري: نتايج نشان داد كه مدلها به خوبي مي توانند فعاليت تركيبات را پيش بيني كنند. همچنين مشخص شد كه تركيبات با قدرت مناسب به بخش صحيحي از رسپتور متصل مي شوند. علاوه بر اين، نتايج مربوط به اعتبارسنجي نشان دادند كه تمامي فرآيند¬ها از اعتبار كافي برخوردار هستند.
شماره ركورد
33296
دانشگاه
علوم پزشكي گيلان