آناليز فيلوژنتيك ژن هاي مقاوم به آنتي بيوتيك هاي خط اول درمان مايكوباكتريوم توبركلوزيس

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

پزشكي

مقدمه: سل ناشي از مايكوباكتريوم توبركلوزيس همچنان يكي از مهم‌ترين مشكلات سلامت عمومي جهان است و مقاومت دارويي آن مانعي جدي در درمان‌هاي خط اول محسوب مي‌شود. بررسي تكاملي ژن‌هاي مقاومت دارويي مي‌تواند الگوي انتشار مقاومت و مسير همگرايي سويه‌ها را مشخص سازد. هدف اين پژوهش، تحليل فيلوژنتيكي و تنوع ژنتيكي هفت ژن اصلي مقاومت دارويي (katG ، inhA، rpoB، embB، pncA، gyrA، gyrB  ) در ايزوله‌هاي جهاني  مايكوباكتريوم توبركلوزيس  بود. روش‌كار: در اين مطالعه، 46 توالي ژني از هفت ژن مقاومت دارويي به‌دست‌آمده از مناطق مختلف جهان (آسيا، اروپا، آمريكاي جنوبي) از پايگاه NCBI استخراج شد. داده‌ها با نرم‌افزار MEGA X تحت چهار روش فيلوژنتيكي ( Maximum Likelihood، Maximum Parsimony، Minimum Evolution و Neighbor Joining  ) تحليل شدند. شاخص‌هاي Fst، AMOVA و PCoA در GenAlEx براي ارزيابي ساختار جمعيتي و تمايز ژنتيكي استفاده گرديد.. يافته‌ها: هر چهار روش فيلوژنتيكي الگوي سه خوشه اصلي (آسياي جنوبي، اروپا، آمريكاي لاتين) را تأييد كردند. ايزوله‌هاي ايران عمدتاً در خوشه آسياي جنوبي قرار گرفتند و بيشترين واگرايي در ژن‌هاي rpoB و embB و كمترين فاصله در gyrB و inhA مشاهده شد. مقدار Fst بيش از 0.45 نشانگر تمايز قابل‌توجه بين جمعيت‌هاي جغرافيايي بود، كه نتايج PCoA و AMOVA نيز آن را تأييد كردند فاصله ژنتيكي بين ايزوله‌ها از 0.003 ( در gyrB بين ايران و هند) تا 4.6 ( در  pncA/embB بين ايران و چين) متغير بود. نتيجه‌گيري: تحليل فيلوژنتيكي و جمعيت‌ژنتيكي 46 توالي از هفت ژن مقاومت دارويي، الگوي تكاملي و خوشه‌بندي جغرافيايي سويه‌هاي  مايكوباكتريوم توبركلوزيس  را به‌صورت جامع مشخص كرد. يافته‌ها بيانگر ارزش رويكردهاي تلفيقي مولكولي در پايش مقاومت دارويي و طراحي مدل‌هاي پيش‌بيني سل مقاوم در سطح منطقه‌اي و جهاني است. كلمات كليدي: مايكوباكتريوم توبركلوزيس، مقاومت دارويي، فيلوژنتيك، فاصله ژنتيكي

236404

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

پزشكي

پزشكي

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

محمدباقر خادم عرفان ، فارس بهرامي