آناليز فيلوژنتيك ژنهاي مقاوم به درمان در انواع ليشمانيا

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

پزشكي

مقدمه: ليشمانيوز يكي از مهم‌ترين بيماري‌هاي انگلي مناطق گرمسيري و نيمه‌گرمسيري است كه به‌ويژه در ايران شيوع قابل‌توجهي دارد. با افزايش گزارش‌هاي مقاومت دارويي در گونه‌هاي مختلف Leishmania، شناسايي و تحليل مولكولي ژن‌هاي مرتبط با مقاومت، به‌ويژه با استفاده از ابزارهاي بيوانفورماتيكي، اهميت بيشتري يافته است. هدف: هدف اين مطالعه، بررسي ژن‌هاي مرتبط با مقاومت دارويي در گونه‌هاي مختلف Leishmania، به‌ويژه در ايزوله‌هاي ايراني، با بهره‌گيري از ابزارهاي بيوانفورماتيكي به‌منظور تحليل توالي‌ها، شناسايي جهش‌ها و ترسيم درخت‌هاي فيلوژنتيك بود. روش‌ها: در اين پژوهش، 39 توالي نوكلئوتيدي از 9 ژن كليدي مرتبط با مقاومت دارويي (MDR1، PTR1، AQP1، SOD1A، SOD1B، ABC، TR، RoS3، PGK) از ايزوله‌هاي انساني و حيواني از ايران و ساير كشورها جمع‌آوري شد. توالي‌ها با استفاده از نرم‌افزارهاي BLAST، ClustalW2، MEGA11 و GenAlEx تجزيه و تحليل شدند. يافته‌ها: نتايج BLAST نشان دادند كه شباهت ژن PTR1 بين ايزوله‌ي ايراني (L. major از خرم‌آباد) و سويه Friedlin سوداني برابر 99.5% و با L. tropica تا 96.5% بود. همچنين در ژن MDR1 ايزوله‌ي ايراني با ايزوله اسپانيايي L. tropica شباهت 98.5% داشت. در هم‌ترازي توالي‌ها، اختلاف نوكلئوتيدي بين ايزوله‌هاي ايراني و جهاني در برخي ژن‌ها كمتر از 10 نوكلئوتيد بود. آناليز فيلوژنتيك نيز نشان داد ايزوله‌هاي ايراني معمولاً با سويه‌هاي مقاوم از هند و برزيل در يك خوشه قرار گرفتند. برخي جهش‌هاي محافظت‌شده در توالي‌هاي AQP1 و PTR1 به‌عنوان ماركرهاي احتمالي مقاومت دارويي شناسايي شدند. نتيجه‌گيري: تحليل‌هاي بيوانفورماتيكي اين مطالعه توانستند نواحي كليدي مرتبط با مقاومت دارويي را در ژن‌هاي Leishmania شناسايي كنند. اين نتايج مي‌توانند مبنايي براي توسعه تست‌هاي تشخيصي مولكولي و طراحي داروهاي هدفمند باشند. انجام مطالعات تكميلي عملكردي و باليني براي تأييد اين يافته‌ها پيشنهاد مي‌شود. كلمات كليدي: ليشمانيا، مقاومت دارويي، بيوانفورماتيك، درخت فيلوژنتيك، تحليل توالي ژن

235673

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

پزشكي

پزشكي

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

محمدباقر خادم عرفان، فارس بهرامي