عنوان
تجزيه و تحليل فيلوژنتيك انواع كريپتوسپوريديوم پارووم در ايران بر اساس ژن gp60
نويسنده اصلي
نگاهبان بنابي، ليلا
محل تحصيل
دانشگاه علوم پزشكي كردستان
رشته تحصيلي
پزشكي
چكيده
مقدمه: كريپتوسپوريديوم يك انگل بازپديد فراموش شده و از عوامل شايع اسهال در جهان است. در حال حاضر بالغ بر 12 گونه از كريپتوسپوريديوم از انسان گزارش شده است كه كريپتوسپوريديوم پارووم شايع ترين گونه گزارش شده از انسان و به دنبال آن كريپتوسپوريديوم هومنيس شايع است. از آنجايي كه شناسايي گونههاي كريپتوسپوريديوم به شناسايي منبع انگل و همچنين محدوده ميزباني كمك مي¬نمايد و اينكه خصوصيات مرفولوژيكي جهت شناسايي گونه كارايي آن چناني ندارد اخيرا استفاده از متدهاي مولكولي جهت شناسايي گونه¬ها، منبع و ميزبان جهت كنترل و پيشگيري مرسوم شده است اين وجود هدف از طراحي اين مطالعه بررسي توالي نوكلئوتيدي مربوط به انواع زير گونه هاي كريپتوسپوريديوم پارووم در ايران و شهر سنندج و مقايسه اين توالي هاي نوكلئوتيدي با نمونه هاي موجود در بانك جهاني ژن است كه با مطالعه حاضر مي توان تنوع ژنيتيكي انواع كريپتوسپوريديوم پارووم موجود در ايران را با ساير نقاط دنيا مقايسه نموده و ارتباط گونه هاي آلوده كننده در انسان و دام و نيز راه هاي احتمالي انتقال آلودگي به انسان را با استفاده از آناليزهاي بيوانفورماتيك مولكولي مورد بررسي قرار داد؛ كه بررسي اين موضوع از لحاظ به كار گيري استراتژي كنترل و پيشگيري مناسب تر و بهبود وضعيت سلامت و رفاه جامعه حائز اهميت است.
روش كار: اين مطالعه به صورت مقطعي انجام شد. محصولات PCR ژن gp60 نمونه هاي كريپتوسپوريديوم پارووم در استان كردستان وگروه هاي مختلف انساني و حيواني از نقاط ديگر ايران و جهان با در بانك جهاني ژن موجود بوده است. پس از بررسي مطالعات مختلف و جستجوهاي انجام شده در بانك جهاني ژن تعداد 25 توالي نوكلئوتيدي ثبت شده از نقاط مختلف جهان و 20 توالي نوكلئوتيدي از ايران براي ژن مذكور انتخاب و آناليز بيوانفورماتيكي با استفاده از برنامه هاي Chromas براي اديت، Blast براي مقايسه ژنها و تعيين همولوژي، ClustalW2 براي مقايسه گروهي ژن ها (alignment)، MEGA12 براي رسم درخت فيلوژني، GenBank براي دريافت ژنهاي مشابه مورد انجام شد. در نهايت با استفاده از تمامي نرم افزارهاي ذكر شده، مقايسه شباهت ها و تفاوت ها و تحليل ژنتيكي انواع ژيارديا در استان كردستان در قياس با ايران و ساير نقاط جهان انجام گرفت.
يافته ها: BLAST پنج نمونه كردستان نشان داد در مورد ساب تايپ 4 نمونه از توالي ها بيشتر با توالي زير گونه هاي IId منطبق هستند، اگرچه زير گروه هاي IId, IIa داراي Node مشترك در اجداد قديمي تر مي باشند و تفاوت آنها بيشتر مرتبط با انتهاي 3ʹ است؛ همچنين ساب تايپ توالي هاي حاصل از بلاست يكي از 5 نمونه بيشتر از نوع IIa بود. همچنين مقايسه ي اين ژن با ساير ژن هاي مشابه در ايران (كه بيشتر ساب تايپ هاي انواع انساني كريپتوسپوريديوم پارووم در ايران مربوط به ساب تايپ هاي IId و IIa مي باشد) نتايج جداگانه اي براي هر يك از نمونه ها نشان داد؛ در مقايسه با نمونه هاي ايران نيز 4 نمونه با ساب تايپ هاي IId و يكي از نمونه ها با نوع IIa همپوشاني داشت.
نتيجه گيري: طبق مقايسه‌هاي فيلوژنتيكي، احتمالاً كريپتوسپوريديوز از طريق انتقال زئونوتيك در اين منطقه رخ مي‌دهند؛ بنابراين، كنترل مناسب و آموزش بهداشت به شدت توصيه مي‌شود تا از بيماري‌هاي زئونوتيك پيشگيري شود. بيش تر پژوهشگران بر اين باورند كه C. parvum پتانسيل زئونوتيك دارد. شواهد اخير نشان مي‌دهند كه زيرگروه‌هاي IIa و IId C. parvum زئونوتيك هستند، در حالي كه زيرگروه‌هاي IIc و IIe آنتروپونوستيك مي‌باشند. تطابق توالي و درخت فيلوژنتيك نشان داد كه Cryptosporidium در سنندج بيشتر مشابه زيرگروه زئونوتيك IIaA C. parvum است تا زيرگروه آنتروپونوستيك IIcA يا Cryptosporidium hominis غالب بودن كريپتوسپوريديوز زئونوتيك در انسان‌ها در كردستان همخواني دارد.
كلمات كليدي: كريپتواسپوريديوم پارووم، فيلوژنتيك، گليكوپروتئين 60 كيلودالتوني (gp60)
شماره ركورد
234990
شهر محل تحصيل
دانشگاه علوم پزشكي كردستان
گرايش رشته تحصيلي
پزشكي
دانشكده
پزشكي
دانشگاه
دانشگاه علوم پزشكي كردستان
استاد راهنما
محمدباقر خادم عرفان، خالد رحماني