عنوان
بررسي و طبقه بندي داده‌هاي مرتبط با كاربرد دِنازيم‌هاي تنظيم‌كننده‌ي بيان ژن
مقطع تحصيلي
كارشناسي ارشد
چكيده
دِنازيم‌ها، اوليگودئوكسي‌نوكلئوتيدهاي تك رشته و داراي خاصيت كاتاليتيك هستند كه حدود سه دهه از كشف آنها مي‌گذرد و تاكنون بيش‌از 1500 توالي دِنازيمي مختلف طراحي و جداسازي شده‌اند كه قادر به كاتاليز حداقل 20 واكنش مختلف مي‌باشند. در اين ميان، مهم‌ترين واكنش كاتاليز شده توسط اين دسته از كاتاليست‌هاي زيستي، واكنش برش رِنا است كه به دِنازيم‌ها قابليت خاموشي بيان ژن هدف، با تكيه بر برش رِناي پيك هدف مي‌دهد و اين دسته از اسيدهاي نوكلئيك عملكردي را به يك ابزار قدرتمند در زمينه‌ي تشخيص و درمان بيماري‌ها تبديل كرده است. علي‌رغم اهميت بالاي حوزه‌ي تنظيم بيان ژن توسط دِنازيم‌ها و تعدد شاخص‌هاي پراهميت در پيرامون كاربرد دِنازيم‌هاي خاموش‌كننده‌ي بيان ژن، تاكنون هيچ پايگاه داده‌ي برخطي در رابطه با حوزه‌ي نام‌برده موجود نمي‌باشد. بنابراين، پژوهش كنوني به بررسي و طبقهبندي داده‌هاي مرتبط با مطالعات صورت گرفته در زمينه‌ي تنظيم بيان ژن توسط دِنازيم‌ها پرداخته، تا در نهايت زمينه براي طراحي و توسعه يك پايگاه داده‌ي برخط و مبتني بر داده‌هاي طبقهبندي شده‌ي نام‌برده، فراهم آيد. در اين راستا، 96 مقاله پژوهشي و مرجع در ارتباط با كاربرد دِنازيم‌ها عليه 12 ژن سرطان‌زاي هدفِ مختلف، منتخب و داده‌هاي مورد نظر از آنها استخراج و در نهايت طبقهبندي شد. به موازات آن، شكل اوليه از بدنه و نحوه‌ي عملكرد پايگاه داده‌ي مورد نظر نيز ترسيم و تدوين گشت. لازم به ذكر است كه پايگاه داده DNAzymeExplorer داراي دامنه‌ي اطلاعاتي مرتبط با 41 دِنازيم مختلف و نيز 917 سنجش آزمايشگاهي و زيستي صورت گرفته در راستاي اعمال و خوانش فعاليت مرتبط با دِنازيم‌هاي مورد نظر، عليه ژن‌هاي هدف است. پايگاه داده‌ي DNAzymeExporer، داراي يك رابط شبكه‌ي كاربرپسند و رابط برنامه نويسي كاربردي باز خواهد بود كه امكان جست‌وجو، مقايسه و ذخيره آسان و سريع توالي دِنازيم‌ها و اطلاعاتي پيراموني آنها و همچنين اطلاعات مرتبط با سنجش‌هاي اعمال‌كننده و خوانشي فعاليت دِنازيم‌ها را به كاربر و پژوهشگر مورد نظر خود مي‌دهد.
شماره ركورد
231481
دانشگاه
دانشگاه اصفهان
رشته تحصيلي
زيست شناسي سلولي مولكولي -بيوشيمي
استاد راهنما
فاطمه جوادي زرنقي