عنوان
مقايسه بيوانفورماتيكي و آزمايشگاهي آنزيم كوتيناز در برخي از سويه‌هاي باكتريايي و قارچي
مقطع تحصيلي
كارشناسي ارشد
چكيده
كوتيناز ها آنزيم‌هايي با وزن مولكولي بالا هستند كه اولين بار در قارچ‌هاي بيماري‌زاي گياهي كشف شدند و قادرند كه تركيبات آلي و تركيبات سنتزي سنگين و پيچيده‌اي مثل پلاستيك‌ها و يا پلي‌استرها را، با شكست پيوند هاي استري در پليمرها تجزيه كنند. كوتيناز همانند ساير آنزيم‌ها مي‌تواند فوايد بسياري براي موجودات زنده و كاربردهاي صنعتي و پزشكي براي انسان داشته باشد. در اين مطالعه از روش‌هاي آزمايشگاهي سنجش آنزيم با استفاده از سوبستراي اختصاصي آنزيم به نام پارانيتروفنيل پالميتات براي كشف، اندازه‌گيري و مقايسه ميزان فعاليت آنزيمي كوتيناز در يكسري سويه‌هاي قارچي و باكتريايي استفاده شد؛ سپس با كمك ابزار هاي مختلف در علم بيوانفورماتيك مانند ابزار سرور هاي MEME، ProtParam، GOR IV، ROC STAR، NCBI، BIOSEQ-Analysis و Interpro به بررسي و مقايسه ويژگي‌هاي پروتئيني كوتيناز در يكسري سويه‌هاي قارچي و باكتريايي پرداختيم. سنجش فعاليت آنزيم، تفاوت واضحي بين يكسري سويه‌هاي قارچي و سويه‌هاي متفاوت باكتريايي نشان نداد. استفاده از ابزارهاي بيوانفورماتيكي، بين ويژگي‌هاي فيزيكوشيميايي و درصد ساختار هاي ثانويه كوتيناز باكتريايي و قارچي تفاوت معنا داري نشان نداد؛ بين ويژگي هاي آب دوستي، آب گريزي و جرم مولكولي توالي هاي پروتئيني كوتيناز قارچي و باكتريايي اختلاف معناداري مشاهده شد. برسي موتيف هاي ساختاري كوتيناز باكتريايي و قارچي پيش بيني شده به وسيله سرور MEME و بار گزاري آنها در Interpro نشان داد كه همه ي موتيف ها داراي فعاليت هيدرولازي، متعلق به خانواده ي آلفا/بتا هيدرولاز ها و متعلق به توالي هاي كوتينازي هستند.
شماره ركورد
227939
دانشگاه
دانشگاه اصفهان
رشته تحصيلي
زيست فناوري- ميكروبي
استاد راهنما
ماندانا بهبهاني , حسن محبت كار