بررسي وفور سيستم هاي كريسپر و ارتباط آن با حضور ژنهاي مرتبط با جزاير بيماري زايي، بتالاكتاماز هاي وسيع الطيف و سكانس تايپ هاي اپيدميك در ميان ايزوله هاي اشرشيا كلي مولد عفونت مجاري ادراري

رشت

مقدمه : عفونت هاي مجاري ادراري ناشي از اشريشيا كلاي به عنوان يك معضل بهداشت جهاني، با رنج بالايي از مرگ ومير در بين بيماران بستري در بيمارستان و در سطح جامعه مطرح مي باشد. بررسي حضور ژن هاي بيماري زايي و همچنين سكانس تايپ هاي غالب در بين سويه هايE. coli توليد كننده ESBL در مطالعات اپيدميولوژيك حائز اهميت مي باشد. امروزه با توجه به افزايش مقاومت هاي آنتي بيوتيكي، نقش حفاظتي سيستم هاي CRISPR در محافظت از باكتري در مقابل DNAهاي خارجي بيش از گذشته مورد توجه قرار دارد. هدف از اين مطالعه بررسي وفور سيستم هاي CRISPR-Cas و ارتباط آن با حضور ژنهاي مرتبط با جزاير بيماري زايي (PAI)، بتالاكتاماز هاي وسيع الطيف (ESBL) و سكانس تايپ هاي غالب (ST) در ميان ايزوله هاي E.coli مولد عفونت مجاري ادراري مي باشد. مواد و روش ها : در مجموع 153 نمونه E. coli از كشت مثبت ادرار بيماران مبتلا به عفونت مجاري ادراري مراجعه كننده به آزمايشگاه بيمارستان رازي شهر رشت جمع آوري شده و در محيط هاي كشت انتخابي و افتراقي كشت داده شدند و بعد از 24 ساعت انكوباسيون ، با استفاده از تست هاي تشخيصي باكتريولوژيك شناسايي باكتري E. coli صورت گرفت. DNA كروموزومي به روش جوشاندن استخراج شد و سپس كيفيت و غلظت DNA استخراج شده با دستگاه نانودراپ مورد بررسي قرار گرفت. سپس با تكنيك PCR شناسايي ژن هاي CRISPR، جزاير بيماري زايي، بتالاكتامازهاي وسيع الطيف و سكانس تايپ هاي غالب نمونه هاي مورد نظر بررسي شدند و بعد از آن محصولات PCR در ژل آگارز الكتروفورز شد. داده ها وارد نرم افزار SPSS نسخه27 شد و براي تحليل داده ها از تست‌ آماري Chi-squared استفاده شد و در سطح معناداري، pvalue كمتر از 0.05 در نظر گرفته شد. نتايج : در بررسي وفور سيستم هاي CRISPR فراواني CRISPR I-E برابر با 4.6% و فراواني CRISPR I-F برابر38% گزارش شد. در بررسي فراواني جزاير بيماري زايي بيشترين فراواني مربوط به PAI IV536(81%) و بدنبال آن PAI ICFT073(34.6%) و PAI IICFT073(30.7%) بودند همچنين در اين مطالعه فراواني ژن هايESBL نيز بررسي شد كه فراواني ژن هاي blaCTX-M ، blaTEM و blaSHV به ترتيب برابر با 49%،51.6%و25.5% بوده است. در اين مطالعه همچنين فراواني سكانس تايپ هاي غالب نيز مورد بررسي قرار گرفت كه بيشترين فراواني مربوط به ST131(27.5%) و بدنبال آن ST95(6.5%) و ST69 (4.6%) بودند. با بررسي ارتباط بين سكانس تايپ هاي غالب، جزاير بيماري زايي (PAI II536 با blaTEM ، PAI IV536 باST131، PAI ICFT073 با ST131، PAI IICFT073 باST73و ST131، PAI IIJ196 با ST73)و بتالاكتاماز هاي وسيع الطيف (blaCTX-M باST95 و ST131 همچنين blaSHV با ST69 و ST131) مشخص گرديدكه در بين آن هاارتباط هاي معناداري وجود دارد. همچنين ارتباط بين سيستم هاي CRISPR با سكانس تايپ هاي غالب (C I-F با ST131)، بتالاكتاماز هاي وسيع الطيف و جزاير بيماري زايي (C I-F با PAI IICFT073) بررسي شد كه مشخص گرديد بين برخي از آن ها ارتباط هاي معناداري بين آن ها وجود دارد. نتيجه گيري : بر اساس يافته هاي مورد مشاهده مي توان نتيجه گرفت كه فراواني سويه هاي مربوط به كلون هاي پاندميك مورد مطالعه كه داراي ژن هاي مقاومت دارويي (ESBL) و ژن هاي بيماري زايي (PAI) بودند، بالا بوده است. لذا قابل ذكر است كه مديريت بهتر عفونت هاي بيمارستاني، كنترل عفونت و بازطراحي پروتكل هاي درماني ميتواند جهت ممانعت از تكثير و انتشار كلون هاي مقاوم و بيماري زا موثر باشد. كليد واژه ها : : اشريشياكلي ، CRISPR، بتالاكتاماز هاي وسيع الطيف، جزاير بيماري زايي،سكانس تايپ هاي غالب

226626

علوم پزشكي گيلان