عنوان
آناليز شبكه هم‌بياني ترانسكريپتوم اسفناج به منظور شناسايي ماژول‌ها و ژن‌هاي كليدي درگير در پاسخ به تنش نيتروژن
نويسنده اصلي
نصراصفهاني، فاطمه
محل تحصيل
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
رشته تحصيلي
كشاورزي
مقطع تحصيلي
كارشناسي ارشد
چكيده
نيتروژن براي رشد و بهره¬وري محصولات به ويژه سبزي¬هاي برگي حياتي است، اما مقادير بالاي اين عنصر باعث تجمع و ايجاد سميت مي¬شود. از آنجايي كه براي درك مكانيسم‌هاي مولكولي جذب، تجمع و متابوليسم نيتروژن در گياهان به ويژه گياه اسفناج به خوبي شناخته شده نيست، در اين مطالعه از اطلاعات ترنسكريپتومي حاصل از بافت¬هاي مختلف گياه اسفناج تحت تاثير تنش نيتروژن براي تجزيه و تحليل ژن‌هاي بيان شده استفاده شد. لذا جهت شناسايي ماژل¬ها و ساخت شبكه¬هاي هم بياني از پكيج WGCNA در نرم¬افزار R استفاده شد. تعداد 4043 ژن با بيان متفاوت در چهار ماژول از جمله، ماژول هاي آبي، قهوه اي، خاكستري و سبز تقسيم بندي شدند كه به ترتيب شامل 832 ، 2027، 109و 1075 بودند. نتايج آناليز غني سازي ژن ها حاكي از آن بود كه ژن هاي مرتبط باتنش نيتروژن در دو ماژول سبز و قهوه اي فراوان¬تر هستند. برخي ژن ها مانند ژن هاي دخيل در مسير response to stimulus كه يكي از مسيرهاي اساسي در پاسخ به تنش نيتروژن مي باشد ميان ژن هاي موجود در دو ماژول سبز و قهوه اي مشترك بود. علاوه بر آن نتايج حاصل حاكي از آن بود كه در پاسخ به تنش نيتروژن برخي مسير ها مانند ion transport،homeostatic process و cation homeostasis به طورمعني داري بيان مي شوند كه شامل بسياري از ژن هاي مرتبط با جذب يا جابه جايي مواد مغذي مي باشند. از جمله ساير مسير هاي معني دار شده در ماژول هاي شناسايي شده در رابطه با تنش نيتروژن مي¬توان به مسير carbon fixation كه شامل ژن هاي فسفوگليسرات كينازها و انولاز ها هستند اشاره كرد. در رابطه با فاكتورهاي رونويسي نيز خانواده¬هاي MYB و WRKY تفاوت بيان معني داري را نشان دادند. ژن هاي سنتز كننده آمينواسيدها مانند گلوتامين آميدترانسفراز ، آسپارژين سنتاز، آمينو ترانسفراز و سرين دكربوكسيلاز در مسير متابوليسم نيتروژن از اهميت بالايي برخوردار بودند. نتايج حاصل از اين مطالعه اطلاعات ارزشمندي در مورد فرآيندهاي مولكولي اساسي در پاسخ به تنش و متابوليسم نيتروژن در اسفناج فراهم مي كند كه مي تواند در ارزيابي ارقام، ژن ها و مكانيسم هاي مرتبط به منظور فرآيند هاي اصلاحي مورد استفاده قرار گيرد.
شماره ركورد
220251
گرايش رشته تحصيلي
بيوتكنولوژي
دانشكده
مهندسي كشاورزي
دانشگاه
دانشگاه صنعتي اصفهان