بررسي ارتباط واريانت هاي مختلف آلفا 1 آنتي تريپسين (A1AT) با شدت بيماري COVID-19

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

بيوشيمي

مقدمه و هدف: در اواخر سال 2019 ، براي سومين بار در اين قرن، بتاكرونا ويروس بسيار بيماري¬زايي به جمعيت انساني منتقل شد. در 7 ژانويه سال 2020 دانشمندان چيني يك كروناويروس جديد (n COV-2019) را از بيماران مبتلا به پنوموني ويروسي جدا كردند، كه پس از آن با افزايش مبتلايان در 12 فوريه سال 2020 بيماري ناشي از كروناويروس جديد توسط WHO تحت عنوان Coronavirus Disease 19 (COVID-19 ) نامگذاري شد. عوارض شايع SARS_COV-2 عبارتند از: نارسايي تنفسي، اختلال عملكرد قلبي- عروقي، كارديوميوپاتي و آسيب حاد كليه، كه غير ازاين¬ها، عوارض ديگري هم دارد. آلفا-1-آنتي تريپسين يك مهار كننده سرين پروتئاز و سومين پروتئين فراوان در گردش خون مي¬باشد. سطح پلاسما AAT مي¬تواند در حالت¬هاي التهاب يا عفونت سيستميك 3 تا 5 برابر افزايش يابد، كه شايد نشان دهنده نقش هموستاتيك AAT باشد. در حالي كه بهترين عملكرد AAT مهار برگشت ناپذير سرين پروتئاز الاستاز مي¬باشد. AATD يك اختلال اتوزومي مي¬باشد ، كه در اثر جهش پلي مورفيك ژن SERPINA1 ايجاد مي-شود. تا به امروز بيش از 100 واريانت SERPINA1 شناخته شده است. كمبود آلفا 1 آنتي تريپسين در شدت بيماري آمفيزم ريوي، بيماري انسداد مزمن ريوي از اهميت ويژه¬اي برخوردار است. SNPها مي-توانند مترادف ياخاموش، (يعني باعث تغيير در اسيد آمينه نشوند) و نامترادف (هنگامي كه اسيد آمينه تغيير مي¬كند) باشند، مدت¬ها تصور مي شد كه SNPهاي مترادف بي اهميت هستند، زيرا توالي اوليه پروتئين حفظ مي¬شود. تعدادي از مطالعات اين فرض را در دهه گذشته زير سوال برده و نشان داده است، كه جهش¬هاي مترادف نيز تحت مي¬توانند در ايجاد بيماري دخيل باشند، تعداد زيادي از شواهد نشان مي-دهد كه SNPهاي مترادف در واقع مي¬توانند عملكردهاي سلولي را مختل كرده و فنوتيپ¬هاي باليني متمايز را ايجاد كنند. SNP¬هاي مترادف، اغلب از طريق تغيير در ساختارmRNA، مي¬توانند ثبات رونويسي را با تغيير توانايي پروتئين¬هاي متصل به RNA در تشخيص رونويسي تغيير دهند. ساختار ثانويه mRN، در تركيب و پردازش pre-mRNA و همچنين كنترل ترجمه از اهميت زيادي برخوردار است، بنابراين، SNP مترادف كه ساختار mRNA را تغيير مي¬دهد، مي¬تواند بر تعداد زيادي از عملكردهاي سلولي تأثير بگذارد. همچنين، بعضي از جهش¬هاي مترادف مي¬توانند، اثرات يك جهش مضر را خاموش كنند (1,2). از ويژگي بارز بيماري نقص ايمني اوليه عفونت¬هاي مكرر ريوي، اختلال در تنظيم سيستم ايمني بدن و بيماري¬هاي خود التهابي است. در نتيجه، شيوع بيماري¬هاي حاد و مزمن ريوي بيشتر است. شايان ذكر است كه عوارض ريوي در PID و AATD ويژگي¬هاي مشابهي دارند. جمعيت بيماران مبتلا به AATD مستعد COVID-19 مي¬باشند، براي بيماران مبتلا به AATD كه آلفا1آنتي تريپسين عملكردي كافي ندارد ، TMPRSS2 با سهولت بيشتري فعال مي¬شود و اجازه مي¬دهد SARS-CoV-2 به سلول¬ها وارد شود. آلفا1 آنتي تريپسين اثرات مهاري بر روي ترومبين و پلاسمين دارد ، بنابراين AATD مي¬تواند با افزايش خطر اختلال انعقادي همراه باشد. اثرات ضد التهابي، مرگ سلولي، ضد پروتئاز و ضد انعقاد آلفا1آنتي تريپسين ناكافي مي¬تواند احتمال آسيب شديد حاد ريه را افزايش دهد. بيماران مبتلا به AATD كه به SARS-CoV-2 آلوده شده¬اند ، ممكن است علائم شديدتري نسبت به افراد عمومي داشته باشند. پلي مورفيسم هاي متعددي بر بيان، فعاليت و عملكرد پروتئين آلفا1آنتي تريپسين تاثيردارند. هدف ازاين مطالعه بررسي ارتباط واريانت هاي مختلف آلفا 1 آنتي تريپسين(A1AT) با شدت بيماري COVID-19 مي¬باشد. مواد و روش ها: بيماران مبتلا به COVID-19 در بيمارستان توحيد سنندج به سه گروه سرپايي، بستري و ICU طبقه بندي شدند، سپس نمونه¬ي سوآب گرفته شده از اوروفارنژيال و نازوفارنژيال كه حاوي DNA تخليص شده بود تهيه گرديد. با استفاده از روش PCR، ژن Serpina1، در بيماران مبتلا به COVID-19 تكثير و سپس از الكتروفورز براي بهينه سازي PCR جهت دستيابي به تك باند اختصاصي استفاده نموده، محصولات PCR را براي تعيين توالي ژن مورد نظر، كه با استفاده از روش سنگرانجام گرفت، به شركت پيشگام ارسال كرده و با استفاده ازپايگاه¬هاي اطلاعاتي NCBI ، نرم افزارتحت وب Clustal Omega، نرم افزار هاي Chromas و CLC پلي مورفيسم¬هاي نمونه¬هاي تعيين توالي شده بررسي گرديد......

206556

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

بيوشيمي

پزشكي

دانشگاه علوم پزشکي کردستان

محمد سعيد هخامنشي، شيركو ناصري