كشف روابط پنهان بين اثرات جانبي داروها با استفاده از الگوريتم هاي گراف كاوي

كارشناسي ارشد

چكيده امروزه با پيشرفتهايي كه در حوزهي زيستي صورت گرفتهاست، امكان مدلسازي دادههاي زيستي فراهم شده است. همين امر منجر به پيدايش انواع شبكههاي زيستي مانند شبكه تعاملي پروتئين-پروتئين، شبكه تعاملي دارو-پروتئين، شبكه تعاملي دارو-دارو و ... شده است. هدف اصلي اين پژوهش بررسي شبكههاي زيستي و ارائه روشي براي استخراج روابط پنهان بين اثرات جانبي داروها است. در اين پژوهش، به دليل اينكه بانك اطالعاتياي از اثرات جانبي داروها وجود ندارد، ما براي ارزيابي نتايج و روش پيشنهادي خود با چالش روبرو هستيم. به همين دليل ما در قدم اول روشهاي سنتي پيشبيني لبه را به عنوان روشهاي پايه براي پيشبيني روابط بين اثراتجانبي پيادهسازي ميكنيم. در قدم دوم با استفاده از خوشهبندي كردن شبكه تعاملي دارو دارو به روش mcl ،و محاسبه شباهت بين اثرات جانبي داروها، كه با خوشههاي دارويي توصيف شدهاند، با استفاده از روش كسينوس، ميزان شباهت بين اثراتجانبي را محاسبه ميكنيم. در قدم سوم، نتايج روش پيشنهادي خود را با روشهاي پايه مقايسه كرده و نشان خواهيم داد كه روش پيشنهادي ما قادر به پيشبيني روابطي است كه روشهاي پايه قادر به پيشبيني آنها نيستند. ما نشان ميدهيم كه در روشهاي محاسباتي، در نظرگرفتن خوشههايي از داروها، كه اين خوشهها بر اساس روابط بين داروها ساخته ميشوند، به عنوان ويژگي براي توصيف اثرات جانبي، عملكرد بهتري را نسبت به در نظر گرفتن خود داروها به عنوان ويژگي براي اثرات جانبي دارد. در نهايت، براي ارزيابي نتايج روش خود در دامنه زيستشناسي، ما باالترين امتيازاتي را كه روابط بين اثرات جانبي به خود اختصاق دادهاند، در مقاالت سايت پابمد جستجو ميكنيم. از اين جستجو در ميابيم كه روش پيشنهادي ما، عالوه بر پيشبيني روابط بديهي اثراتجانبي مانند ارتباط بين سردرد و حالت تهوع، روابطي را كه اخيرا دانشمندان اين حوزه به آنها دست يافتهاند نيز به درستي پيشبيني كرده است. از اين روابط ميتوان به رابطهي )Hyperphagia , Parasomnia( ،)Xeroderma ,Telangiectasia )و )Hypercapnia, Breathholding )اشاره كرد و همچنين موفق به كشف روابطي شدهاست كه كماكان شاهد آنها در مقاالت معتبر نيستيم، كه ميتوان اين روابط را براي بررسي در اختيار دانشمندان اين lymphadenitis( و( lymphadenitis, hyperphagia( ،)Abasia, Neck tightness( روابط. داد قرار حوزه ,compulsions )از دسته روابطي هستند كه در مقاالت بررسي شده مشاهده نشده است. كلمات كليدي: گرافكاوي، خوشهبندي گراف، خوشهبندي، پيشبيني لبه، بيوانفورماتيك، اثرات جانبي داروها

192870

دانشگاه علم و صنعت ايران

نرم افزار

دكتر حسين رحماني