بهبود فرآيند سنجش در آزمايش توالي يابي دي.ان.اي درون كانال سيال

كارشناسي ارشد

ارايه روشي براي توالي يابي مولكول دي ان اي كه بي نياز از تكنيك هاي اتصال مولكولي و همچنين كنترل سينماتيك حركت مولكولي باشد، قادر به كاهش هزينه و افزايش سرعت در توالي يابي با تسهيل فرايند انجام آزمايش توسط اپراتور است. آنزيم اگزونوكلئاز طي واكنش شيميايي قادر به جداسازي متوالي مولكول هاي نوكلئوتيد از رشته دي ان اي مي باشد. در واقع آنزيم نقش واسطه درترجمه اطلاعات بيومولكولي مربوط به توالي دي ان اي به شكل ديجيتال را ايفا ميكند. هنگامي كه واكنش آنزيمي در مجاورت سطح تراشه ساخته شده با روش هاي ريزفناوري انجام شود مولكول هاي نوكلئوتيد جدا شده، به ترتيب صحيح قابل شناسايي هستند. در اين رساله نشان خواهيم داد كه وسيله نيمه هادي با ناهمگوني متناوب در ساختار سطحي قادر به شناسايي پيوسته و زنجيره وار مولكول هاي نوكلئوتيد در جهت '5-مونوفسفات با متوسط صحت 8/99 درصد است. همچنين توانايي سنجش و شناسايي مولكول متيل شده سيتوزين از چهار پايه استاندارد سازنده دي ان اي: گوانين، آدنين، تيامين و سيتوزين در دسترس مي باشد. با رعايت شرايط اجراي آزمايش توالي يابي به صورت سازگار با كينتيك واكنش آنزيمي، و با تكيه بر اطلاعات ديجيتالي كسب شده در خروجي مي توان از تغييرات تفكيك پذير امپدانس حسگر درحين جدايش، پايه هاي دي ان اي را شناسايي و توالي يابي كرد. حصول اطلاعات ديجيتال از روند تغييرات امپدانس با قرار دادن حسگر به عنوان المان مدار درمدار الكتريكي طراحي شده ميسر مي گردد. حساسيت سنسور به قدري است كه پايه هاي مختلف در فرايند جدايش از طريق تاثير متفاوتي كه بر شدت تغييرات امپدانس مي گذارند قابل تفكيك وشناسايي اند. اين حسگر، مناسب براي تجميع با ديگر تراشه هاي ميكروالكترومكانيكي-ريزسيالاتي، جهت توالي يابي مولكول دي ان اي موجود در نمونه دلخواه بسته به كاربرد مطلوب مي باشد.

190980

دانشگاه علم و صنعت ايران

مهندسي پزشكي - بيومكانيك

دكتر ساسان آسيائي